MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSG_M

Total Repeats: 625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020288	TAA	2	6	1921	1926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816491
2	NC_020288	TTG	2	6	1992	1997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816491
3	NC_020288	AGT	2	6	2086	2091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816491
4	NC_020288	TGA	2	6	2255	2260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816491
5	NC_020288	CAACT	2	10	2436	2445	40 %	20 %	0 %	40 %	451816491
6	NC_020288	C	6	6	2602	2607	0 %	0 %	0 %	100 %	451816491
7	NC_020288	G	6	6	2622	2627	0 %	0 %	100 %	0 %	451816491
8	NC_020288	ATC	2	6	2694	2699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816491
9	NC_020288	TTGG	2	8	2728	2735	0 %	50 %	50 %	0 %	451816491
10	NC_020288	TGA	2	6	2741	2746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816491
11	NC_020288	CA	3	6	2895	2900	50 %	0 %	0 %	50 %	451816491
12	NC_020288	TCT	2	6	2929	2934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816491
13	NC_020288	TCC	2	6	3025	3030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816492
14	NC_020288	CCA	2	6	3117	3122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816492
15	NC_020288	CTGC	2	8	3129	3136	0 %	25 %	25 %	50 %	451816492
16	NC_020288	CGG	2	6	3174	3179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816492
17	NC_020288	GTT	2	6	3268	3273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816492
18	NC_020288	AAT	2	6	3319	3324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816492
19	NC_020288	TCC	2	6	3334	3339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816492
20	NC_020288	ACA	2	6	3378	3383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816492
21	NC_020288	CA	3	6	3412	3417	50 %	0 %	0 %	50 %	451816492
22	NC_020288	CCG	2	6	3466	3471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816492
23	NC_020288	GA	3	6	3519	3524	50 %	0 %	50 %	0 %	451816492
24	NC_020288	CGC	2	6	3526	3531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816492
25	NC_020288	CAC	2	6	3536	3541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816492
26	NC_020288	AAT	2	6	3556	3561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816492
27	NC_020288	TTC	2	6	3621	3626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816492
28	NC_020288	TTC	2	6	3675	3680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816493
29	NC_020288	TCT	3	9	3793	3801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816493
30	NC_020288	CCT	2	6	3846	3851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816494
31	NC_020288	TAA	2	6	3856	3861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816494
32	NC_020288	TCA	2	6	3900	3905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816494
33	NC_020288	AG	3	6	3919	3924	50 %	0 %	50 %	0 %	451816494
34	NC_020288	CGG	2	6	3943	3948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816494
35	NC_020288	CGG	2	6	3957	3962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816494
36	NC_020288	ATG	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816494
37	NC_020288	C	6	6	3986	3991	0 %	0 %	0 %	100 %	451816494
38	NC_020288	TAG	2	6	4037	4042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816494
39	NC_020288	GAA	2	6	4045	4050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816494
40	NC_020288	AGA	2	6	4051	4056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816494
41	NC_020288	GCG	2	6	4233	4238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816494
42	NC_020288	TTC	2	6	4289	4294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816494
43	NC_020288	GGT	2	6	4301	4306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816494
44	NC_020288	GAT	3	9	4331	4339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816494
45	NC_020288	T	8	8	4343	4350	0 %	100 %	0 %	0 %	451816494
46	NC_020288	AT	3	6	4371	4376	50 %	50 %	0 %	0 %	451816494
47	NC_020288	TC	3	6	4377	4382	0 %	50 %	0 %	50 %	451816494
48	NC_020288	CAA	2	6	4514	4519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816495
49	NC_020288	TCC	3	9	4659	4667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816496
50	NC_020288	TCA	2	6	4677	4682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816496
51	NC_020288	CCA	2	6	4684	4689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816496
52	NC_020288	AGG	2	6	4713	4718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816496
53	NC_020288	TCT	2	6	4719	4724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816496
54	NC_020288	TGT	2	6	4850	4855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816496
55	NC_020288	TTGC	2	8	4885	4892	0 %	50 %	25 %	25 %	451816496
56	NC_020288	TGG	2	6	4904	4909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816496
57	NC_020288	AAT	2	6	5023	5028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816496
58	NC_020288	AAC	2	6	5170	5175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816496
59	NC_020288	A	6	6	5340	5345	100 %	0 %	0 %	0 %	451816496
60	NC_020288	TGA	2	6	5434	5439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816496
61	NC_020288	AGT	2	6	5460	5465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816496
62	NC_020288	GCC	2	6	5473	5478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816496
63	NC_020288	TTG	2	6	5481	5486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816496
64	NC_020288	TTG	2	6	5496	5501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816496
65	NC_020288	ATTG	2	8	5514	5521	25 %	50 %	25 %	0 %	451816496
66	NC_020288	TTG	2	6	5529	5534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816496
67	NC_020288	TGG	2	6	5555	5560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816496
68	NC_020288	AGA	2	6	5565	5570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816496
69	NC_020288	TAA	2	6	5628	5633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816496
70	NC_020288	TCA	2	6	5638	5643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816496
71	NC_020288	TAA	2	6	5722	5727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816496
72	NC_020288	TAA	2	6	5791	5796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816496
73	NC_020288	GGT	2	6	5865	5870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816496
74	NC_020288	TTCC	2	8	5933	5940	0 %	50 %	0 %	50 %	451816496
75	NC_020288	CAA	2	6	6084	6089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816497
76	NC_020288	CTG	2	6	6211	6216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816497
77	NC_020288	CCT	2	6	6258	6263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816497
78	NC_020288	TCA	2	6	6267	6272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816497
79	NC_020288	CAA	2	6	6277	6282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816497
80	NC_020288	G	6	6	6363	6368	0 %	0 %	100 %	0 %	451816497
81	NC_020288	TCA	2	6	6374	6379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816497
82	NC_020288	CGA	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816498
83	NC_020288	C	6	6	6552	6557	0 %	0 %	0 %	100 %	451816498
84	NC_020288	CAA	2	6	6663	6668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816499
85	NC_020288	CAA	2	6	6676	6681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816499
86	NC_020288	TCC	2	6	6869	6874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816499
87	NC_020288	AAC	2	6	6875	6880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816499
88	NC_020288	CCA	2	6	6924	6929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816499
89	NC_020288	CA	3	6	6928	6933	50 %	0 %	0 %	50 %	451816499
90	NC_020288	GCC	2	6	6940	6945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816499
91	NC_020288	CTT	2	6	6991	6996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816499
92	NC_020288	TCT	2	6	7002	7007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816499
93	NC_020288	CTT	2	6	7023	7028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816499
94	NC_020288	CGG	2	6	7065	7070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816499
95	NC_020288	ACC	2	6	7190	7195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816499
96	NC_020288	TTC	2	6	7238	7243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816499
97	NC_020288	CTC	2	6	7312	7317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816499
98	NC_020288	AGA	2	6	7368	7373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816499
99	NC_020288	GCG	2	6	7426	7431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816499
100	NC_020288	GAC	2	6	7472	7477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816499
101	NC_020288	ATC	2	6	7580	7585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816499
102	NC_020288	C	6	6	7646	7651	0 %	0 %	0 %	100 %	451816499
103	NC_020288	AGTC	2	8	7662	7669	25 %	25 %	25 %	25 %	451816499
104	NC_020288	AGG	2	6	7687	7692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816499
105	NC_020288	AG	3	6	7696	7701	50 %	0 %	50 %	0 %	451816499
106	NC_020288	CAG	2	6	7789	7794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816499
107	NC_020288	CCT	2	6	7833	7838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816499
108	NC_020288	CCT	2	6	7860	7865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816499
109	NC_020288	CTC	2	6	7897	7902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816499
110	NC_020288	C	6	6	7918	7923	0 %	0 %	0 %	100 %	451816499
111	NC_020288	G	6	6	8022	8027	0 %	0 %	100 %	0 %	451816499
112	NC_020288	GTT	2	6	8050	8055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816499
113	NC_020288	GCG	2	6	8068	8073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816499
114	NC_020288	GAC	2	6	8493	8498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816500
115	NC_020288	TGT	3	9	8595	8603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816500
116	NC_020288	CAG	2	6	8839	8844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816501
117	NC_020288	GGC	2	6	8921	8926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816501
118	NC_020288	ATA	2	6	8948	8953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816501
119	NC_020288	T	6	6	9006	9011	0 %	100 %	0 %	0 %	451816501
120	NC_020288	GTG	2	6	9041	9046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816501
121	NC_020288	CCCT	2	8	9088	9095	0 %	25 %	0 %	75 %	451816501
122	NC_020288	AT	3	6	9112	9117	50 %	50 %	0 %	0 %	451816501
123	NC_020288	TAA	2	6	9138	9143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816501
124	NC_020288	CTG	2	6	9145	9150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816501
125	NC_020288	CCA	2	6	9153	9158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816501
126	NC_020288	T	6	6	9369	9374	0 %	100 %	0 %	0 %	451816502
127	NC_020288	GAC	2	6	9450	9455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816502
128	NC_020288	CTG	2	6	9493	9498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816502
129	NC_020288	TTC	2	6	9508	9513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816502
130	NC_020288	GGT	2	6	9526	9531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816502
131	NC_020288	TCGT	2	8	9574	9581	0 %	50 %	25 %	25 %	451816502
132	NC_020288	ACT	2	6	9608	9613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816502
133	NC_020288	GAAG	2	8	9760	9767	50 %	0 %	50 %	0 %	451816503
134	NC_020288	CCG	2	6	9828	9833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816503
135	NC_020288	ACTT	2	8	9982	9989	25 %	50 %	0 %	25 %	451816504
136	NC_020288	AG	4	8	9992	9999	50 %	0 %	50 %	0 %	451816504
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254	NC_020288	GA	3	6	19959	19964	50 %	0 %	50 %	0 %	451816513
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258	NC_020288	TCA	2	6	20170	20175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816513
259	NC_020288	G	7	7	20277	20283	0 %	0 %	100 %	0 %	451816513
260	NC_020288	TC	3	6	20390	20395	0 %	50 %	0 %	50 %	451816513
261	NC_020288	GCTG	2	8	20405	20412	0 %	25 %	50 %	25 %	451816513
262	NC_020288	TCC	2	6	20418	20423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816513
263	NC_020288	GCC	2	6	20493	20498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816513
264	NC_020288	GT	3	6	20516	20521	0 %	50 %	50 %	0 %	451816513
265	NC_020288	T	6	6	20593	20598	0 %	100 %	0 %	0 %	451816513
266	NC_020288	GCC	2	6	20700	20705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816513
267	NC_020288	GTA	2	6	20716	20721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816513
268	NC_020288	TGT	2	6	20794	20799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816513
269	NC_020288	TGG	2	6	20809	20814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816513
270	NC_020288	GGTT	2	8	20817	20824	0 %	50 %	50 %	0 %	451816513
271	NC_020288	AGA	2	6	20948	20953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816513
272	NC_020288	TGA	2	6	21001	21006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816513
273	NC_020288	AGG	2	6	21136	21141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816513
274	NC_020288	GAT	2	6	21161	21166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816513
275	NC_020288	GAC	2	6	21176	21181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816513
276	NC_020288	ACA	2	6	21235	21240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816513
277	NC_020288	TGG	2	6	21371	21376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816514
278	NC_020288	CTG	2	6	21411	21416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816514
279	NC_020288	GCA	2	6	21442	21447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816514
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282	NC_020288	AG	4	8	21975	21982	50 %	0 %	50 %	0 %	451816515
283	NC_020288	CCAA	2	8	22007	22014	50 %	0 %	0 %	50 %	451816515
284	NC_020288	GTT	2	6	22049	22054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816515
285	NC_020288	GAA	2	6	22077	22082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816515
286	NC_020288	CAG	3	9	22133	22141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816515
287	NC_020288	AGA	2	6	22213	22218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816515
288	NC_020288	C	8	8	22265	22272	0 %	0 %	0 %	100 %	451816515
289	NC_020288	CAGC	2	8	22293	22300	25 %	0 %	25 %	50 %	451816515
290	NC_020288	TGC	2	6	22577	22582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816516
291	NC_020288	GTTG	2	8	22748	22755	0 %	50 %	50 %	0 %	451816516
292	NC_020288	CGA	2	6	22779	22784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816516
293	NC_020288	A	6	6	22814	22819	100 %	0 %	0 %	0 %	451816516
294	NC_020288	GTTG	2	8	22820	22827	0 %	50 %	50 %	0 %	451816516
295	NC_020288	AG	3	6	22828	22833	50 %	0 %	50 %	0 %	451816516
296	NC_020288	AGA	2	6	22894	22899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816516
297	NC_020288	CATT	2	8	22900	22907	25 %	50 %	0 %	25 %	451816516
298	NC_020288	CAA	2	6	22967	22972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816516
299	NC_020288	CAA	2	6	23446	23451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816517
300	NC_020288	AACAA	2	10	23462	23471	80 %	0 %	0 %	20 %	451816517
301	NC_020288	GGAA	2	8	23481	23488	50 %	0 %	50 %	0 %	451816517
302	NC_020288	A	6	6	23564	23569	100 %	0 %	0 %	0 %	451816517
303	NC_020288	CGG	2	6	23605	23610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816517
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321	NC_020288	AT	3	6	24814	24819	50 %	50 %	0 %	0 %	451816519
322	NC_020288	TGGTC	2	10	25148	25157	0 %	40 %	40 %	20 %	451816520
323	NC_020288	GGAGCG	2	12	25189	25200	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	451816520
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335	NC_020288	CT	3	6	25670	25675	0 %	50 %	0 %	50 %	451816520
336	NC_020288	ATT	2	6	25805	25810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816520
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339	NC_020288	AAC	2	6	25920	25925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816520
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351	NC_020288	TTGG	2	8	26822	26829	0 %	50 %	50 %	0 %	451816520
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383	NC_020288	CTC	2	6	28536	28541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816523
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387	NC_020288	TGT	2	6	28780	28785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816523
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391	NC_020288	GTG	2	6	28891	28896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816523
392	NC_020288	AAG	2	6	28901	28906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816523
393	NC_020288	GCAT	2	8	28916	28923	25 %	25 %	25 %	25 %	451816523
394	NC_020288	CAG	2	6	29011	29016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816524
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471	NC_020288	CAA	2	6	33736	33741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816528
472	NC_020288	GCTATA	2	12	33758	33769	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451816528
473	NC_020288	CCA	3	9	33794	33802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816528
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475	NC_020288	CGC	2	6	33871	33876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816528
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479	NC_020288	CGCTG	2	10	34028	34037	0 %	20 %	40 %	40 %	451816528
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485	NC_020288	GTA	2	6	34505	34510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816528
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492	NC_020288	CTGG	2	8	35166	35173	0 %	25 %	50 %	25 %	451816528
493	NC_020288	ATG	2	6	35186	35191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816528
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495	NC_020288	ATC	2	6	35296	35301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816528
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497	NC_020288	ACCGGC	2	12	35338	35349	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	451816528
498	NC_020288	GCCCCC	2	12	35398	35409	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	451816528
499	NC_020288	CGA	2	6	35436	35441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816528
500	NC_020288	CTG	2	6	35866	35871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816528

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